基于BSA-seq的拟南芥辐射诱变突变体的基因定位

辐射诱变极易导致染色体结构变异,目前鲜有采用BSA-seq方法定位辐射诱变突变体基因的研究报道。为探索BSA-seq用于辐射诱变突变体的基因定位的可行性,本研究通过https://www.selleck.cn/products/E7080.html辐射诱变筛选得到一个拟南芥突变体,将其与亲本杂交,在F2代分离群体中根据表型筛选单株,构建两个极端表型的子代混池;将两个子代混池与亲本混池进行全基因组测序,使用MutMap、QTL-seq和GPS等多种BSA-seq定位策略对其进行定位分析。结果表明,多种BSA-seq定位策略均取得了一致的结果,在2号染色体上获得7 Mb的初步定位区间;使用IGVBiopsy needle软件对该区间内的基因组进行可视化,发现该区间内存在25 189 bp的大片段缺失,缺失区段包含6个基因;通过SnpEff进行突变位点注释,经基因注释信息推测AT2G28610为selleck NMR候选基因;通过遗传学试验验证了该候选基因为突变基因。本研究结果为应用BSA-seq技术定位辐射诱变得到的突变位点提供了参考。

孕早期NLR、RDW和PLR与妊娠期糖尿病发生的相关性研究

目的:探selleck HPLC讨孕早期孕妇中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、红细胞体积Brain biopsy分布宽度(RDW和血小板/淋巴细胞比值(PLR)水平与妊娠期糖尿病发生的相关性。方法:选取2020年5月—2021年10月于赣州市妇幼保健院进行孕检的266例妊娠8~12周的孕早期孕妇为研究对象,于妊娠24~2CH-2231918周时行75 g OGTT检查,根据检查结果将研究对象分为研究组(妊娠期糖尿病孕妇88例)和对照组(健康孕妇178例)。于妊娠8~12周孕检时经XN2000全自动血细胞分析仪检测孕早期孕妇NLR、RDW和PLR水平;于妊娠24~28周孕检时经AU5821全自动生化仪检测孕妇空腹血糖(FPG)、服糖后1 h血糖(1 h PG)、服糖后2 h血糖(2 h PG)水平;Pearson分析孕妇孕早期NLR、RDW和PLR水平与FPG、1 h PG、2 h PG水平的相关性;受试者操作特征(ROC)曲线分析孕妇孕早期NLR、RDW和PLR水平对妊娠期糖尿病的诊断效能。结果:与对照组相比,研究组孕妇NLR、RDW、PLR、FPG、1 h PG、2 h PG水平均显著高(P<0.05);孕早期孕妇NLR、RDW和PLR水平与FPG、1 h PG、2 h PG水平呈正相关(P<0.05);NLR、RDW、PLR预测妊娠期糖尿病的AUC分别为0.846、0.870、0.848,最佳截断值分别为3.64、11.60%、132.23。结论:孕早期孕妇NLR、RDW和PLR水平显著高,与FPG、1 h PG、2 h PG水平均呈正相关,并且与妊娠期糖尿病的发生密切相关,对其具有较好的预测诊断效能。

EGFR-TKI同步化疗或序贯治疗EGFR-TP53共突变型晚期非小细胞肺癌的疗效观察

目的 观察EGFR-TP53共突变型晚期非小细胞肺癌患者采用EGFR-TKI靶向同步化疗、EGFR-TKI单靶治疗序贯化疗、EGFR-TKI单靶治疗序贯靶向联合化疗的效果及预后情况,探讨最佳治疗方案。方法 2016年6月-2021年8月河南省人民医院诊治EGFR-TP53共突变型晚期非小细胞肺癌患者229例,其中一线EGFR-TKI单靶治疗111例(其中40例治疗后进展且无驱动基因突变),EGFR-TKI靶向同步化疗71例(靶向同步化疗组),EGFR-TKI靶向同步抗血管生成药物治疗32例,化疗15例。患者从治疗起始每2个周期行影像学等检查,采用RECIST标准评估疗效,至患者死亡或随访结束。采用单因素及多因素Cox回归分析EGFR-TP53共突变型晚期非小细胞肺癌患者预后的影响因素。40例一线EGFR-TKI单靶治疗后进展且无驱动基因突变者分为单靶序贯靶向联合化疗组24例和单靶序贯化疗组16例。比较靶向同步化疗组、单靶序贯靶向联合化疗组和单靶序贯化疗组客观缓解率、疾病控制率及治疗反应持续时间≥3个RP56976月比率;绘制Kaplan-Meier曲线,采用log-rank检验比较3组总生存期及无疾病进展生存期。结果 一线治疗方案中EGFR-TKI靶向同步化疗是EGFR-TP53共突变型晚期非小细胞肺癌患者预后良好的影响因素(HR=0.597,95%CI:0.383~0.932,P=0.023)。靶向同步化疗组、单靶序贯靶向联合化疗组、单靶序贯化疗组客观缓解率(49.3%、54.2%、31.3%)、疾病控制率(97.2%https://www.selleck.cn/products/cobimetinib-gdc-0973-rg7420.html、95.8%、87.5%)及治疗反应持续时间≥3个月比率(88.7%、91.7%、81.3%)比较差异均无统计学意义(P>0.05)。单靶序贯靶向联合化疗组中位总生存期(1 542 d)、中位无疾病进展生存期(722 d)均长于靶向同步化疗组(826、487 d)、单靶序贯化Bioaccessibility test疗组(515、278 d)(P<0.05),靶向同步化疗组中位无疾病进展生存期长于单靶序贯化疗组(χ~2=4.464,P=0.035),中位总生存期与单靶序贯化疗组比较差异无统计学意义(χ~2=0.278,P=0.598)。结论 化疗协同EGFR-TKI靶向治疗可增加EGFR-TP53共突变型晚期非小细胞肺癌患者对EGFR-TKI靶向药物的敏感性,改善患者预后;靶向同步化疗可作为一线治疗方案,单靶治疗进展后可选择靶向联合化疗治疗。

基于“肾脑同治”人参鹿茸药对防治肾阳虚证的网络药理学研究

本研究基于“肾脑同治寻找更多”的中医基础理论,应用网络药理学分析,探讨人参鹿茸药对防治肾阳虚证的物质基础与分子机制。利用TCMSP平台、Gene Cards数据库获取此药对的活性成分及作用靶点,利用SoFDA平台获取肾阳虚证相关靶点,Metascape数据库获取所涉信号通路信息,Cytoscape软件构建“病证药物成分靶点通路”网络,BioGPS数据库获取靶点在人体各器官中表达情况,联合STRING数据库生物信息学网站进行核心活性成分与关键靶标的筛选并进行分子对接。筛选出人参鹿茸药对中117种活性成分,其中包括17-β-雌二醇、三AY-22989分子量磷酸腺苷、十六烷酸等9种核心活性成分,与肾阳虚证相关的150个预测靶点,其中包括APOE、B2M、APP等11个核心预测靶点,在肾、脑、肾上腺中表达情况相似,表达量较高的包含有APOE、B2M等17个programmed stimulation靶点,以及主要与PI3K-Akt信号通路和神经内分泌网络相关。本文应用生信分析研究人参鹿茸防治肾阳虚症的分子机制,并为其“肾脑同治”理论提供科学依据。

类风湿关节炎患者关节液来源外泌体lncRNA表达谱的初步研究

背景:类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种以免疫紊乱和炎症导致的滑膜炎及进行性关节软骨和骨破坏为主要特征的自身免疫性疾病,发病机制至今尚未完全明确,因此,探索RA的发病机制及生物标记物具有重要意义。RA关节液中免疫细胞活化和免疫分子分泌可能参与疾病的发生。外泌体是细胞产生的胞外囊泡,通过将RNA等物质运送至靶细胞来发挥生物学功能。长链非编码RNA(long-chain non-coding RNA,lncRNA)是长度>200个核苷酸的RNA,在细胞分化、炎症和免疫反应等过程中发挥重要作用。目前尚无RA患者关节液来源外泌体lncRNA表达谱的相medicolegal deaths关报道。目的:本研究旨在探讨RA患者关节液来源外泌体lncRNA表达谱,并对差异表达lncRNAs的靶基因进行生物信息学分析。方法:共采集9名RA、11名痛风、10名骨关节炎(osteoarthritis,OA)患者的关节液,其中RA为实验组,痛风、OA为对照组。使用传统超速离心法提取关节液外泌体,使用HiPure Liquid RNA/miRNA试剂盒提取外泌体RNA,通过lncRNA测序检测关节液外泌体中lncRNAs的表达情况,绘制聚类热图反映差异表达lncRNAs的相对含量,筛选RA患者关节液来源外泌体中差异表达lncRNAs,并对其靶基因进行功能富集分析。通过实时定量逆转录 PCR(real time quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)验证差异 lncRNAs 的表达水平,并对lncRNAs表达水平与临床指标进行相关性分析。结果:在RA患者关节液来源外泌体中共检测到1067个差异表达lncRNAs。与OA相比,在RA中共发现347个差异表达lncRNAs,其中有236个表达上调(包括ENST00000430787.1 和 ENST00000451781.1),111 个表达下调(包括 NR_145469.1 和ENST00000552334NSC 127716生产商.1);差异表达lncRNAs靶基因的功能分析显示主要富集于“T细胞活化”、“凋亡”及“mTOR信号通路”。与痛风相比,在RA中共发现805个差异表达lncRNAs,其中有479个表达上调(包括ENST00000562852.1和ENST00000420522.1),326个表达下调(包括ENST00000590368.1和ENST00000433344.1);差异表达lncRNAs靶基因的功能分析显示主要富集于“自噬的正向调节”、“白细胞跨内皮迁移”及“铁死亡”。同时与OA、痛风相比,在RA中共发现85个特异表达lncRNAs,其中有65个表达上调(包括ENST00000430787.1 和ENST00000420522.1),20个表达下调(包括NR_145462.1 和NR_145461.1);特异表达lncRNAs靶基因的功能分析显示主要富集于“自噬”、“RA疾病通路”及“mTOR信号通路”。qRT-PCR结果显示,与OA、痛风相比,RA中ENST00000433825.1 水平升高;与痛风相比,RA 中 ENST00000449119.1 水平降低;qRT-PCR所验证的差异表达lncRNAs组间变化趋势均与lncRNA测序结果中的相一致。相KPT-330作用关性分析发现RA患者ENST00000433825.1、ENST00000449119.1与C反应蛋白水平及红细胞沉降率呈正相关,与类风湿因子及抗环瓜氨酸多肽抗体均呈负相关,其中ENST00000433825.1与C反应蛋白的相关性最显者(P<0.001)。结论:与OA、痛风相比,RA患者关节液来源外泌体中lncRNA表达谱具有明显差异。生物信息学分析提示RA中差异表达lncRNAs通过调控靶基因来发挥“自噬、mTOR信号通路”等生物学功能。RA患者ENST00000433825.1与C反应蛋白呈显著正相关,提示ENST00000433825.1可能RA的潜在生物标志物,为探索RA的发病机制提供了新的线索。

淮南猪肌肉组织不同发育阶段的甲基化差异基因筛选

为研究淮南猪肌肉组织不同发育阶段的甲基化水平差异,筛选调控肌肉发育的甲基化差异基因,选取胚胎期第38天、58天、78天和出生后第21天的淮南公猪背最长肌,开展全基因组甲基化测序并通过信号通路富集分析筛选候选基因。结果显示,基因主体的CpG甲基化程度高于基因上下游2K的甲基化,基因组元件中内含子、3’UTR和重复序列等甲基化程度最高。随着发育时间的增加,基因主体的Cp获悉更多G甲基化水平逐渐下降,上下游2K则是下降-上升-下降趋势。基因组元件中内含子区、3’UTR区和重复序列的甲基化水平都逐渐下降,启动子区则为下降-上升-DNA Damage/DNA Repair抑制剂下降趋势。信号通路富集分析显示,在淮南猪相邻的发育阶段,黏着斑信号通路存在CpG甲基化差异基因,且达到极显著水平(P=0.0009、P=0.0004、P=0.0001),细胞粘附连接信号通路存在CHH甲基化差异基因,且达到极显著水平(P=0.0132、P=0.0128、P=0.0005),并通过生物信息学分析在两个信号通路中筛选了ACTN4、FGFR1作为肌肉发育候选基因。综上,淮南猪肌肉组织不同发育阶段发现了2个甲基化差异基因,分别与肌动蛋白结合和肌肉细胞分化相关,Chinese herb medicines其甲基化变化有助于理解胚胎期肌肉发育的分子机制。。

替格瑞洛联合强化阿托伐他汀治疗NSTE-ACS

目的 探究替格瑞洛与强化阿托伐他汀联合用药治疗非ST段抬高型急性冠脉综合征(NSTE-ACS)的疗效及对血清γ-谷氨酰基转移酶(GGT)、冠状动脉病变SYNTAX-Ⅱ评分和血管内皮功能的影响。方法 选取九江学院附属医院心内科2019年6月至2021年3月收治的年龄30~85岁的NSTE-ACS患者100例,按照随机数字表法分为联用组(n=50,替格瑞GSI-IX采购洛与强化阿托伐他汀联合用药)和常规组(n=50,氯吡格雷与常规剂量阿托伐他汀联合用药)。比较两组治疗NSTE-ACS的整体有效率及治疗前后血清GGT指标、SYNTAX-Ⅱ评分、肱动脉静息状态内径、血管内皮依赖性舒张功能(FMD)、非依赖性血管内皮舒张功能(NMD)和峰值血流变化率的变化情况。结果 联用组治疗有效率(47/50,94.0%)高于常规组(42/50,84.0%),差异具有统计学意义(P<0.05);两组治疗1月血清GGT水平均比治疗前低,联用组治疗1月、治疗3月的血清GGT水平[(35.32±3.07)U/L、(29.70±5.15)U/L]明显低于常规组[(49.41±2.15)U/L、(33.69±4.13)U/L],差异具有统计学意义(P<0.05);两组治疗前SYNTAX-Ⅱ评分PF-03084014分子量无统计学差异(P>0.05),两组治疗后SYNTAX-Ⅱ评分均降低,且联用组治疗3月[(19.37±3.21)分]低于常规组[(22.15±3.46)分],差异具有统计学意义(P<0.05);两组患者肱动脉静息状态内径和NMD在治疗前后不存在统计学差异(P>0.05),两组FMD和峰值血流变化率在联合用药治疗后都比治疗前有所上升,联用组治疗后FMD[(6.25±1.06)%]、峰值血流变化率[(52.76±5.14Bioelectrical Impedance)%]上升幅度高于常规组FMD[(5.54±1.08)%、(47.26±3.51)%],差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 对NSTE-ACS患者使用替格瑞洛联合强化阿托伐他汀的治疗效果比常规用药好,血管内皮功能明显改善,可以有效降低血清GGT水平及SYNTAX-Ⅱ评分且更能抑制冠状动脉病变。

植物乳杆菌L3发酵乳的工艺优化及质量研究

云南具有丰富的益生菌资源,前期从immune cytokine profile云南牛奶样品中筛选的植物乳杆菌L3具有良好的发酵特性(产黏、产BYL719溶解度香)和产共轭亚油酸性能,具有较好的发酵乳加工潜力。本研究以植物乳杆菌L3为发酵乳菌株,优化植物乳杆菌L3发酵乳的工艺参数,研究产品的质量指标和贮藏性能。通过单因素试验筛选和响应面优化,确定的植物乳杆菌L3发酵乳最佳工艺为:菌株添加量2%,发酵温度37℃,发酵时间20h。发酵乳产品色泽均匀,质地细腻,无乳清析出,酸奶味纯正,酸甜适口;脂肪含量为(3.42±0.36)%、蛋白质含量为(3.24±0.42)%、共轭亚油酸含量为(131.53±4.7)μg/g;乳酸菌活菌数(1.72×10~(10)±0.36)CFU/g;共轭亚油酸含量和乳酸菌GW4869小鼠活菌数均高于商业发酵剂发酵乳。植物乳杆菌L3发酵乳在4℃下贮藏21d时,乳酸菌活菌数均高于国标规定的10~6CFU/g,酸度均在消费者接受的范围内。本试验对植物乳杆菌L3发酵乳的工艺优化和品质分析,为植物乳杆菌L3在发酵乳中的应用奠定了基础。

基于PI3K/Akt通路探讨灵泽片对前列腺增生大鼠的干预机制

目的 基于PI3K/Akt通路探讨灵泽片对良性前列腺增生大鼠的干预机制。方法 将40只SPF级SD大鼠随机等分为正常组、模型组、非那雄胺组、灵泽片低剂量组、灵泽片高剂量组。除正常组外,余各组大鼠采用非去势丙酸睾酮诱导法建立前列腺增生大鼠模型。造模结束后,正常组及模型组选用生理盐水,非那雄胺组、灵泽片低剂量组及灵泽片高剂量组分Virologic Failure别选用相应药物,连续灌胃给药28天。灌胃结束后处死大鼠,取前列腺组织,观察各组大鼠前列腺指数、组织结构及PI3K/Akt信号通路相关蛋白的变化。结果 与正常组比较,模型组大鼠前列腺组织增生明显,https://www.selleck.cn/products/dinaciclib-sch727965.html前列腺指数及PI3K、Akt、Bcl-2蛋白表达水平上升(P<0.01),Bax蛋白表达水平下降(P<0.01)。与模型Emricasan作用组比较,非那雄胺组、灵泽片高剂量组大鼠前列腺指数及Bcl-2、PI3K及Akt蛋白表达水平下降(P<0.01),Bax蛋白表达水平上升(P<0.01);灵泽片低剂量组前列腺指数及PI3K、Akt、Bcl-2蛋白表达降低,Bax蛋白表达增高,但仅前列腺指数与Akt蛋白表达水平差异有统计学意义(P<0.05)。结论 灵泽片可能通过负向调控PI3K/Akt信号通路,下调PI3K、Akt及Bcl-2蛋白表达水平,上调Bax蛋白表达水平,抑制细胞增殖和促进细胞凋亡,从而发挥对BPH的治疗作用;高剂量使用灵泽片时治疗效果更佳。

具有非局部弱阻尼和反阻尼的Kirchhoff型板方程的长时间动力学行为

本硕士学位论文主要研究具有非局部弱阻尼和反阻尼的Kirchhoff型板方程的此网站全局适定性,耗散性及全局吸引子的存在性.具体内容如下:首先,当非线性项g满足次临界增长时,运用带有局部Lipschitz扰动的m-增生算子的发展方程的适定性理论证明了具有非局部弱阻尼和反阻尼的线性Kirchhoff型板方程的全局适定性,再通过构造一个新的Gronwall不等式证明了该系统的耗散性.接着,利用(C)条件的方法证明了该系统的渐近紧性,最后得到了全局吸引子的存在性.接下来,结合非局部弱阻尼项k‖购买BMS-354825u_t‖~pu_t的单调性,并利用单调算子理论建立了具有非局部弱阻尼和反阻尼的非线性Kirchhoff型板Augmented biofeedback方程的全局适定性.其次,通过构造一个新的Gronwall不等式获得了该系统的耗散性.然后利用先验估计和能量重构的方法获得了该系统的渐近光滑性,进而得到了该系统全局吸引子的存在性.