基于m6A相关长链非编码RNA鉴定克罗恩病的潜在诊断生物标志物

目的 探索克罗恩病(CD)m6A相关的长链非编码RNA(LncRNA)及其与患者临床性状的相关性。方法 通过GEO数据库获取CD芯片数据,获取m6A相关的甲基化酶的表达量,通过差异分析筛选LncRNA。分析与m6A甲基化酶共表达的LncRNA,探索LncRNA与CD患者病情活动的相关性并绘制ROC曲线,对LncRNA共表达的m RNA进行Gimmune trainingO富集分析及KEGG信号通路分析。结果 共筛选出CD中m6A相关的LncRNA 7个,3个LncRNA与8个m6A甲基化酶存在相关性。其中,LncRNAGSEC与病情活动指标CDEIS呈正相关。m6A甲基化位点预测提示GSEC存在多个PD0325901小鼠高甲基化位点;ROC曲线下面积为0.805。GO富集分析显示其富集于蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性、Toll样受体结合等功能。Berzosertib说明书KEGG信号通路分析显示其富集于NF-κB信号通路、炎症性肠病等通路。结论 GSEC可能是CD潜在的诊断及治疗靶点。