上海地区血液EGFR基因突变检测室间质量评价回顾分析

目的 利用室间质量评价(EQA)分析上海地区临床实验室血液表皮生长因子受体(EGFR)基因突变项目的检测能力。方法 选用含有特定EGFR突变位点的肿瘤细胞系,通过超声断裂基因组DNA制备可人工模拟游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)的基因片段,经片段长度鉴定及突变频率检测后作为EQA样本。选取5份样本随机编号后发送至参评实验室,要求其在规定时间内进行检测并上传结果,依据回报结果综合评价其检测能力。结果 2019年至2021年分别收到有效回报结果 33、29和27确认细节份。参评实验室最常用的方法为ARMS法,分别为66.7%(22/33)、75.9%(22/29)和74.1%(20/27),其次为dPCR法和NGS法,分别为12.1%(4/33)、13.8%(4/29)、14.8%(4/27)和21.2%(7/33)、10.3%(3/29)、11.1%(3/27)。回报结果完全正确的实验室分别为78.8%(26/33)、89.7%(26/29)和96.3%(26/27),成绩不合格实验室分别为9.1%(3/33)、3.4%(1/29)和3.7%(1/27)。样本的整体符合率分别为92.7%(153/165)、97.2%(141/145)和98.5%(133/13GNE-140细胞培养5)。不符合样本中,假阳性率分别为1.8%(3/165)、1.4%(2/145)和0%(0/Immune signature135),假阴性率分别为5.5%(9/165)、1.4%(2/145)和1.5%(2/135)。结论 上海地区临床实验室血液EGFR基因突变检测整体符合率较高,但个别实验室检测能力尚待提高。此外,临床实验室应通过参加EQA活动以持续改进其检测质量。